日本栽培葡萄的历史传说是源于公元718年的山梨县，当时那里开始栽培葡萄，也可能用葡萄生产出了葡萄酒。真正有文献记载的是在十六世纪，葡萄牙耶稣会传教士抵达日本后将带来的葡萄牙葡萄酒作为礼物进献给当时日本的地方长官，随后，传教士们不仅继续运送葡萄酒到日本，还使用本地的葡萄混合酿造出了古老的shinshu葡萄酒。
日本山梨县属大陆型气候，日夜温差大
使葡萄皮的生长更丰厚，酿造的葡萄酒因此更有风味在日本明治维新的19世纪60年代后期，日本本地葡萄酒产业开始启动，山梨县于1875年的第一次正式生产出了本地的葡萄酒。公元1877年，宫崎光太郎、土屋龙宪、高野正诚等一批日本青年前往法国波尔多学习酿酒技术，宫崎光太郎回国后创立了日本第一个现代葡萄酒酿造企业——“大日本山梨县葡萄酒株式会社”，拉开了日本葡萄酒现代产业的序幕。
1886年大日本山梨县葡萄酒株式会社结束营业，
宫崎为扩大葡萄酒销售通路，1888年于日本东京开设“甲斐产商店”贩售各式葡萄酒品，
1892年成立“宫崎第一酿造所”在那一时期，日本开始从欧洲引种酿製葡萄酒，由于经历了数次严重的病害，从欧洲引种的葡萄几经灭绝，后改为从美国引种抗病力强的葡萄。直到二战结束后，随着日本国内掀起的农业革命浪潮，葡萄酒产业开始逐渐成长壮大。特别是影响全国的“一村一特色/一村一品”运动，使得多个地区的葡萄栽培和葡萄酒酿造业有了很大发展。
不过那时相对于日本大量进口国外的瓶装葡萄酒和原酒而言，日本国内的葡萄酒产量仍然是微不足道。日本人并不喜欢葡萄酒的酸涩味，而是喜欢甜蜜的口味，所以，在酿造本地的葡萄酒时，日本人大量添加白糖使葡萄酒饮用起来温和“甘口”。
这一状况一直持续到20世纪60年代，随着日本的经济腾飞和消费水平的提高，大量的进口葡萄酒和伴随而来的国外葡萄酒文化的影响，日本的葡萄酒消费和口味呈现了多样化。那些有品味的消费者开始遗弃国产葡萄酒而崇尚进口的欧美葡萄酒。这也刺激了日本国产葡萄酒生产企业对品质提升的要求。
从20世纪70年代起，迫于国外产品的压力，日本葡萄酒行业也开始把目标定在生产出高品质的国产葡萄酒上面，这时日本才真正的开始认真学习西方的先进酿酒经验，发展酿酒葡萄的栽培，专门引进培育试种筛选了适合本地栽培的抗病虫害能力强的国外葡萄品种，并利用日本先进的农业科技研究的优势，培育出适合本地条件的嫁接改良品种。
不仅如此，日本各葡萄酒生产企业还积极输送人才到国外学习酿酒技术，探索适合本地原料的酿酒工艺，提高酿酒技术水平，使得日本葡萄酒的品质有了很大的提高，逐渐开始得到国外葡萄酒行业同行的认可和日本国内葡萄酒消费者的认可，并在国内外各种葡萄酒评比大赛中获得了多个奖项。此外，日本还积极发展有机葡萄酒的生产，以适应消费市场对绿色食品的需求。
从2002年开始，山梨县还倡导“日本的葡萄酒只用100%日本葡萄”，以提高本土葡萄酒的民族品牌形象。
目前日本全国大小葡萄酒生产企业约200多家，
葡萄酒年生产量在10多万吨，产量在世界上排名第28位如同许多葡萄酒爱好者朗朗上口的品种，如：黑皮诺(Pinot Noir)、夏多内(Chardonnay)、梅洛(Merlot)、卡本内苏为浓(Cabernet Sauvignon)等，日本最有名的代表性品种就是“甲州 Koshu”，这个品种一千多年前藉着“丝路”的传播，来到日本，当时只作为鲜食使用，直到1877年时，当时日本明治政府为了学习西方的现代化，特别责成高野政成与土屋龙宪从法国学习最新的种植与酿造技术。
山梨县之所以成为日本葡萄酒重镇(超过日本葡萄酒总产量的40%)，是因为天气是大陆性气候，早晚温差大，使得葡萄皮可以生长丰厚，酿成的葡萄酒也会更有风味，而且，亚洲葡萄酒的种植问题在于颱风过多，强风与降雨集中，都会对葡萄造成伤害（对于葡萄而言，雨水要越少越好），山梨县位在富士山的北侧，每次颱风侵袭时，富士山宛如坚实的臂弯一般，让山梨县安全度过每一次的颱风。
日本本土原生的山葡萄品种有16种之多， 由于这些原生的山葡萄品种酸度高含糖量低，因此目前已很少被日本葡萄酒生产企业用于生产葡萄酒，而在北海道地区还有相当一部分企业在使用本地原生山葡萄与国外酿酒葡萄、本土鲜食葡萄嫁接改良的葡萄品种来生产中、低端葡萄酒。
甲州葡萄：这是在日本最有名的也是栽种最多的一个本土白葡萄品种。甲州葡萄皮色粉红，易于日本本州地区栽培，既可以鲜食又可以酿酒。经过日本葡萄酒界的多年不懈努力和日本农业科技研究人员的大力配合，通过改良酿造工艺和装置等手段，终于用甲州葡萄酿出了使国内外葡萄酒界认可的高品质白葡萄酒。
日本甲州(Koshu)葡萄酒，独特的花果香，海内外皆有不错销售成绩日本培育的Muscat Bailey-A（マスカットべリーa ）红葡萄品种，是由日本的川上善兵卫（1868-1944年）引种到日本新泻县的。川上的目标是选育一个适应日本的气候的葡萄品种。他杂交“Bailey/ベーリ”葡萄与“玫瑰香”葡萄得到了Muscat Bailey-A ，后来这个品种被广泛的在日本栽培。近年来，Muscat Bailey-A葡萄还採取晚收风乾的製法酿造甜型葡萄酒。Muscat Bailey-A还与欧系品种混酿，生产出具备波尔多、勃艮第风格的葡萄酒。
日本土生红葡萄品种-Muscat Bailey-A在日本有“日本酿酒厂协会”但没有全国範围内的葡萄酒相关法律，不论本国酿酒厂使用哪国的原酒或什么品种的葡萄，统统被标记为“日本酒”。正因如此，有一些日本市面销售的“日本产葡萄酒”实际上是使用了进口原酒。
但是，目前日本有些地区也採用了类似法国的AOC制度和美国的(AVA)的“原产地标记”。长野县使用“称谓的管理制度”，山梨县，甲府市是採用“葡萄酒域的原产地认证规例”，而目前日本许多酒厂在酒标上标明“100%使用日本产葡萄原料酿製”以表明其纯国产的身份。
